يُستخدم تحليل التدفق الخلوي على نطاق واسع لتقييم كفاءة النقل الجيني (Transfection Efficiency)، مما يوفّر بيانات كمية دقيقة على مستوى الخلية المفردة حول نسبة الخلايا التي تم إدخال الجين إليها ومستوى التعبير الجيني.
دراسات التعبير الجيني:
تقييم كفاءة إدخال البلازميدات المرمّزة لبروتينات فلورية مثل GFP، وتتبع تسليم shRNA /siRNA.
نقل الفيروسات:
تحليل كفاءة النقل باستخدام فيروسات lentivirus أو retrovirus في خلايا مستهدفة مثل CAR-T.
تحرير الجينوم بتقنية CRISPR-Cas9:
رصد امتصاص RNPs الموسومة فلوريًا، وفرز الخلايا المعدّلة باستخدام مؤشرات مثل GFP+.
تطوير العلاجات:
تحسين طرق النقل غير الفيروسي (مثل الجسيمات النانوية الدهنية أو الكهربة) خاصة في لقاحات mRNA.
إنتاج خطوط خلوية مستقرة:
فرز واختيار الخلايا المتحولة باستخدام مقاومات دوائية، وتحديد تلك ذات التعبير العالي للجين المنقول.